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R
Executable File
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source(here::here("R/common/db_client.R"))
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save_or_return <- function(results, write_to_db = FALSE) {
|
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if (isTRUE(write_to_db)) {
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df <- as.data.frame(results, optional = TRUE)
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status <- insert_results(df)
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return(status)
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}
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results
|
|
}
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#' TODO voir ce qu'on retourne -> surement tableau de résultats, stockage en base géré dans une autre fonction
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#' Met à jour les données éCow pour un cheptel
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#' @param cheptel character. Code du cheptel avec le FR
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#' @return A définir
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maj_ecow_by_cheptel <- function(cheptel) {
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list_chep <-list(cheptel)
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maj_ecow_for_list_cheptels(list_chep)
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|
}
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#' Met à jour les données éCow pour tous les cheptels suivis par un technicien
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#' @param tech character. Identifiant à 5 lettres du technicien
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maj_ecow_by_tech <- function(tech) {
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# On récupère tous les cheptels d'un technicien
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cheps_tech <- get_cheptels_by_tech(tech)
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# On en extrait la liste des numéros de cheptels suivi par le tech
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list_chep <- as.list(cheps_tech$numeroCheptel)
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maj_ecow_for_list_cheptels(list_chep)
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|
}
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#' Met à jour les données éCow pour tous les cheptels des adhérents actifs
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maj_ecow_for_all <- function() {
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# On récupère tous les adhérents dans Dolibarr
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adh_hbc <- get_all_adherents_active()
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# On en extrait la liste des numéros de cheptels
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list_chep <- as.list(adh_hbc$Numchep)
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maj_ecow_for_list_cheptels(list_chep)
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|
}
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mafonctiondetest <- function(cheptel){
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source(here::here("R/common/ws_client.R"))
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cheptel_ecow <- get_cheptel_ecow(cheptel)
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vaches <- cheptel_ecow$vaches
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return(length(vaches))
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}
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#' Mise à jour de l'indicateur Ecow pour une liste de cheptels et gestion des erreurs
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#' @param list_cheptels list. Liste de numéros de cheptels avec le FR devant
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maj_ecow_for_list_cheptels <- function(list_cheptels){
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total <- length(list_cheptels)
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start_time <- Sys.time()
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message(sprintf("🚀 Début traitement - %s cheptels à traiter", total))
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res <- lapply(seq_along(list_cheptels), function(i) {
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num_chep <- list_cheptels[[i]]
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withCallingHandlers(
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tryCatch(
|
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{
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message(sprintf("[%s/%s] Traitement cheptel %s ...", i, total, num_chep))
|
|
out <- calcul_ecow_by_chep(num_chep, 1) # Pour l'instant on s'arrête aux vaches
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|
message(sprintf("✓ OK cheptel %s", num_chep))
|
|
out
|
|
},
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error = function(e) {
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|
message(sprintf("✗ ERREUR cheptel %s : %s", num_chep, conditionMessage(e)))
|
|
NULL
|
|
}
|
|
),
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|
warning = function(w) {
|
|
message(sprintf("! AVERTISSEMENT cheptel %s : %s", num_chep, conditionMessage(w)))
|
|
invokeRestart("muffleWarning")
|
|
}
|
|
)
|
|
})
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end_time <- Sys.time()
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duration_sec <- round(as.numeric(difftime(end_time, start_time, units = "secs")), 2)
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|
duration_fmt <- format_duration(duration_sec)
|
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message(sprintf("🏁 Fin traitement - %s cheptels traités en %s", total, duration_fmt))
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|
|
return(res)
|
|
}
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|
format_duration <- function(seconds) {
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|
h <- as.integer(seconds %/% 3600)
|
|
m <- as.integer((seconds %% 3600) %/% 60)
|
|
s <- as.integer(seconds %% 60)
|
|
|
|
sprintf("%02d:%02d:%02d", h, m, s)
|
|
}
|
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|
|
save_data_vaches <- function(vaches){
|
|
tabfinal <- vaches %>%
|
|
select(
|
|
cheptelDetenteur, anim, nom, nom_pere, embryon, donneuse, porteuse,
|
|
tempsprod, age_years, ecowcarr, rg_carr,
|
|
ptgV, agevel1, ivv1, ivv2Brut,
|
|
prol, mort, txrepros, nbpp,
|
|
txvf, pn_m, pn_f,
|
|
p120_m, p120_f, p210_m, p210_f,
|
|
ptgP,
|
|
moyecowcamp, rg_camp
|
|
) %>%
|
|
arrange(rg_carr)
|
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|
# Renomme les colonnes pour correspondre aux noms des champs dans la table ecow_vaches
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|
colnames(tabfinal) <- c(
|
|
"cheptel", "num_vache", "nom_vache", "pere", "isu", "donneuse", "porteuse", "pourc_vie_productive", "age_annees", "note_ecow_carr", "rang_carr", "pointage_vache", "age_1_velage_m", "ivv1_j",
|
|
"ivv2plus_j", "prolificite_pourc", "mortalite_av_sevr_pourc", "pourc_produits_repros", "nb_petits_produits", "pourc_velages_tranquilles", "pn_males_kg",
|
|
"pn_femelles_kg", "p120_males_kg", "p120_femelles_kg", "p210_males_kg", "p210_femelles_kg", "pointage_produits", "moy_notes_ecow_campagne", "rang_campagne"
|
|
)
|
|
|
|
tab_format <- tabfinal %>%
|
|
mutate(
|
|
across(
|
|
where(is.character),
|
|
~ str_replace_all(.x, ",", ".")
|
|
),
|
|
isu = case_when(
|
|
isu == "O" ~ TRUE,
|
|
isu == "N" ~ FALSE,
|
|
TRUE ~ NA
|
|
),
|
|
rang_carr = as.numeric(rang_carr)
|
|
)
|
|
|
|
con <- get_db_connection()
|
|
|
|
dbWriteTable(
|
|
con,
|
|
Id(schema = "hbc", table = "ecow_vaches"),
|
|
tab_format,
|
|
append = TRUE,
|
|
row.names = FALSE
|
|
)
|
|
dbDisconnect(con)
|
|
}
|
|
|
|
save_data_campagne <- function(synth_camp){
|
|
# Stockage des données écow_camp
|
|
filtered_prod_camp <- synth_camp %>%
|
|
select(
|
|
cheptel, numeroMipg, dateNaiss, rangVelageMipg, ecowcamp, nom_pere, produits
|
|
)
|
|
|
|
colnames(filtered_prod_camp) <- c(
|
|
"cheptel", "mere_ipg", "danais", "ravelamer_corr", "note_ecow", "pere", "produits"
|
|
)
|
|
|
|
con <- get_db_connection()
|
|
|
|
dbWriteTable(
|
|
con,
|
|
Id(schema = "hbc", table = "ecow_campagne"),
|
|
filtered_prod_camp,
|
|
append = TRUE,
|
|
row.names = FALSE
|
|
)
|
|
dbDisconnect(con)
|
|
}
|
|
|
|
save_data_taureau <- function(data_taureaux, cheptel){
|
|
# Stockage des données écow_taureaux
|
|
filtered_taureaux <- data_taureaux %>%
|
|
select(
|
|
cheptelDetenteur, pereGenetique, nb_prod_in_chep, utilgen, prol, mort, txrepros, nbpp, txvf, pnm, pnf, p120m, p120f, p210m, p210f,
|
|
dmsev, dssev, afsev, nbfilles_avecprod, pctfilles_avecprod, isu_fillestot, age_sort_fillestot, agevel1_fillestot, ivv1_fillestot, ivv2p_fillestot,
|
|
vieprod_fillestot, dmad_fillestot, dsad_fillestot, afad_fillestot, nbprod_fillestot, txrepros_fillestot, nbpp_fillestot, prol_fillestot,
|
|
mort_fillestot, txvf_fillestot, nbfillesact_avecprod, pctfillesact_avecprod, isu_fillesact, age_sort_fillesact, agevel1_fillesact, ivv1_fillesact,
|
|
ivv2p_fillesact, vieprod_fillesact, dmad_fillesact, dsad_fillesact, afad_fillesact, nbprod_fillesact, txrepros_fillesact, nbpp_fillesact,
|
|
prol_fillesact, mort_fillesact, txvf_fillesact, nbfilles_renouv
|
|
)
|
|
|
|
colnames(filtered_taureaux) <- c(
|
|
"cheptel", "anim", "nb_prod_in_chep", "utilgen", "prol", "mort", "txrepros", "nbpp", "txvf", "pnm", "pnf", "p120m", "p120f", "p210m", "p210f",
|
|
"dmsev", "dssev", "afsev", "nbfilles_avecprod", "pctfilles_avecprod", "isu_fillestot", "age_sort_fillestot", "agevel1_fillestot", "ivv1_fillestot", "ivv2p_fillestot",
|
|
"vieprod_fillestot", "dmad_fillestot", "dsad_fillestot", "afad_fillestot", "nbprod_fillestot", "txrepros_fillestot", "nbpp_fillestot", "prol_fillestot",
|
|
"mort_fillestot", "txvf_fillestot", "nbfillesact_avecprod", "pctfillesact_avecprod", "isu_fillesact", "age_sort_fillesact", "agevel1_fillesact", "ivv1_fillesact",
|
|
"ivv2p_fillesact", "vieprod_fillesact", "dmad_fillesact", "dsad_fillesact", "afad_fillesact", "nbprod_fillesact", "txrepros_fillesact", "nbpp_fillesact",
|
|
"prol_fillesact", "mort_fillesact", "txvf_fillesact", "nbfilles_renouv"
|
|
)
|
|
|
|
filtered_taureaux$cheptel <- cheptel
|
|
|
|
con <- get_db_connection()
|
|
|
|
dbWriteTable(
|
|
con,
|
|
Id(schema = "hbc", table = "ecow_taureaux"),
|
|
filtered_taureaux,
|
|
append = TRUE,
|
|
row.names = FALSE
|
|
)
|
|
dbDisconnect(con)
|
|
}
|
|
|
|
save_data_lignees <- function(stats_lignees){
|
|
con <- get_db_connection()
|
|
|
|
dbWriteTable(
|
|
con,
|
|
Id(schema = "hbc", table = "ecow_lignees"),
|
|
stats_lignees,
|
|
append = TRUE,
|
|
row.names = FALSE
|
|
)
|
|
dbDisconnect(con)
|
|
} |