Ajout donneuses/porteuses
This commit is contained in:
@@ -35,8 +35,12 @@ http_get <- function(url, method = "GET", params = NULL, headers = NULL, auth =
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get_cheptel_ecow <- function(num_cheptel){
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get_cheptel_ecow <- function(num_cheptel){
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url_active_by_chep <- paste0(server_path, "webresources/animals/findInventaireEcowByChep/")
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url_active_by_chep <- paste0(server_path, "webresources/animals/findInventaireEcowByChep/")
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active_by_chep <- http_get(url = paste0(url_active_by_chep, num_cheptel))
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active_by_chep <- http_get(url = paste0(url_active_by_chep, num_cheptel))
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donneuses <- active_by_chep$donneuses
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active_by_chep$donneuses <- NULL
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# Nettoyage des données pour les listes reçues
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# Nettoyage des données pour les listes reçues
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active_by_chep <- lapply(active_by_chep, clean_data_anims)
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active_by_chep <- lapply(active_by_chep, clean_data_anims)
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active_by_chep$donneuses <- donneuses
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return(active_by_chep)
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}
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}
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#' Renvoie la liste des adhérents HBC actifs dans Dolibarr
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#' Renvoie la liste des adhérents HBC actifs dans Dolibarr
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@@ -43,7 +43,11 @@ calcul_ecow_by_chep <- function(cheptel, step = 3) {
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taureaux %>% select(anim, nom_pere = nom),
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taureaux %>% select(anim, nom_pere = nom),
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by = c("pereGenetique" = "anim")
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by = c("pereGenetique" = "anim")
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)
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)
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# Ajout info donneuses
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donneuses <- cheptel_ecow$donneuses
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vaches$donneuse <- vaches$anim %in% donneuses
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# Récupère les produits ajout des données manquantes
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# Récupère les produits ajout des données manquantes
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produits_cheptel <- add_data_ecow(cheptel_ecow$produits, czhbc)
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produits_cheptel <- add_data_ecow(cheptel_ecow$produits, czhbc)
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@@ -54,7 +58,7 @@ calcul_ecow_by_chep <- function(cheptel, step = 3) {
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# Récupère les effets cheptel # TODO A REVOIR AVEC LAURENA
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# Récupère les effets cheptel # TODO A REVOIR AVEC LAURENA
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effets <- get_effets_cheptel(produits_vaches)
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effets <- get_effets_cheptel(produits_vaches)
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rapport_MF <- effets$rapport_MF
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rapport_MF <- effets$rapport_MF
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prod_vaches_corr <- apply_effet_chep(produits_vaches, effets$effets_chep, effets$rapport_MF)
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prod_vaches_corr <- apply_effet_chep(produits_vaches, effets$effets_chep, effets$rapport_MF)
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# On récupère les coefficients de pondération pour les pointages au sevrage
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# On récupère les coefficients de pondération pour les pointages au sevrage
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@@ -95,7 +95,7 @@ format_duration <- function(seconds) {
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save_data_vaches <- function(vaches){
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save_data_vaches <- function(vaches){
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tabfinal <- vaches %>%
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tabfinal <- vaches %>%
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select(
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select(
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cheptelDetenteur, anim, nom, nom_pere, embryon,
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cheptelDetenteur, anim, nom, nom_pere, embryon, donneuse, porteuse,
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tempsprod, age_years, ecowcarr, rg_carr,
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tempsprod, age_years, ecowcarr, rg_carr,
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ptgV, agevel1, ivv1, ivv2Brut,
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ptgV, agevel1, ivv1, ivv2Brut,
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prol, mort, txrepros, nbpp,
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prol, mort, txrepros, nbpp,
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@@ -108,7 +108,7 @@ save_data_vaches <- function(vaches){
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# Renomme les colonnes pour correspondre aux noms des champs dans la table ecow_vaches
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# Renomme les colonnes pour correspondre aux noms des champs dans la table ecow_vaches
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colnames(tabfinal) <- c(
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colnames(tabfinal) <- c(
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"cheptel", "num_vache", "nom_vache", "pere", "isu", "pourc_vie_productive", "age_annees", "note_ecow_carr", "rang_carr", "pointage_vache", "age_1_velage_m", "ivv1_j",
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"cheptel", "num_vache", "nom_vache", "pere", "isu", "donneuse", "porteuse", "pourc_vie_productive", "age_annees", "note_ecow_carr", "rang_carr", "pointage_vache", "age_1_velage_m", "ivv1_j",
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"ivv2plus_j", "prolificite_pourc", "mortalite_av_sevr_pourc", "pourc_produits_repros", "nb_petits_produits", "pourc_velages_tranquilles", "pn_males_kg",
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"ivv2plus_j", "prolificite_pourc", "mortalite_av_sevr_pourc", "pourc_produits_repros", "nb_petits_produits", "pourc_velages_tranquilles", "pn_males_kg",
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"pn_femelles_kg", "p120_males_kg", "p120_femelles_kg", "p210_males_kg", "p210_femelles_kg", "pointage_produits", "moy_notes_ecow_campagne", "rang_campagne"
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"pn_femelles_kg", "p120_males_kg", "p120_femelles_kg", "p210_males_kg", "p210_femelles_kg", "pointage_produits", "moy_notes_ecow_campagne", "rang_campagne"
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)
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)
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@@ -115,7 +115,7 @@ get_synth_prod_vaches <- function(vaches, produits, params_ponderation){
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campn_max = {cn <- campagneNaiss[!is.na(campagneNaiss)]; if (length(cn)) max(cn) else NA_integer_},
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campn_max = {cn <- campagneNaiss[!is.na(campagneNaiss)]; if (length(cn)) max(cn) else NA_integer_},
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nbcampvel = ifelse(!is.na(campn_min) & !is.na(campn_max),
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nbcampvel = ifelse(!is.na(campn_min) & !is.na(campn_max),
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campn_max - campn_min + 1, NA_integer_),
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campn_max - campn_min + 1, NA_integer_),
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#porteuse = summary$embryon,
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porteuse = any(embryon == 'O'),
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# date du dernier anais (dernier événement)
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# date du dernier anais (dernier événement)
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last_danais = {d <- dateNaiss[!is.na(dateNaiss)]; if (length(d)) max(d) else as.Date(NA)},
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last_danais = {d <- dateNaiss[!is.na(dateNaiss)]; if (length(d)) max(d) else as.Date(NA)},
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@@ -198,7 +198,7 @@ get_synth_prod_vaches <- function(vaches, produits, params_ponderation){
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prol = round(n_veaux / nbcampvel * 100, 1),
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prol = round(n_veaux / nbcampvel * 100, 1),
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# pointage produits
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# pointage produits
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ptgP = round(pps$devmus * mean_devmus + pps$devsqe * mean_devsqe + pps$af * mean_af, 1)
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ptgP = ifelse( is.na(mean_devmus), NA_real_, round(pps$devmus * mean_devmus + pps$devsqe * mean_devsqe + pps$af * mean_af, 1))
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) %>%
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) %>%
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# Conversion des NaN en NA sur certaines moyennes
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# Conversion des NaN en NA sur certaines moyennes
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mutate(across(
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mutate(across(
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Reference in New Issue
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