[eCow] Correctif environnement

R/common/ws_client.R

@@ -142,14 +142,13 @@ get_params_ponderation <- function(num_cheptel){
 
 #' Récupère le nombre de veaux total par parents à partir d'une extraction excel complétée par les données SPIE
 #' Le nombre renvoyé est le nombre total tous cheptels confondus, sans détail sur les veaux
-get_parents_ipg <- function(){
+get_parents_ipg <- function(cheptel){
   # Extraction du fichier excel contenant les données de la table bovide du SIG jusqu'au 06/01/2026
   meresIPG <- read_csv(paste(rep_imp, "nb_prod_IPG_byMERE_20260106.csv", sep=''), show_col_types = FALSE)
   colnames(meresIPG) <- c('ANIM','NBPRODSIG')
-  
   # Extraction SPIE pour compléter à partir du 03/01/2026 (choix date pour essayer de limiter les doublons et manquement) 
   url_meres_spie <- paste0(server_path, "webresources/spie/nbprodbymeresince2026/")
-  meres_spie_brut <- http_get(url = paste0(url_meres_spie, num_cheptel))
+  meres_spie_brut <- http_get(url = paste0(url_meres_spie, cheptel))
   meres_spie <- as.data.frame(meres_spie_brut, stringsAsFactors = FALSE)
   colnames(meres_spie) <- c('ANIM','NBPRODSPIE')
   meres_spie$NBPRODSPIE <- as.numeric(meres_spie$NBPRODSPIE)
@@ -164,7 +163,7 @@ get_parents_ipg <- function(){
   
   # Extraction SPIE pères
   url_peres_spie <- paste0(server_path, "webresources/spie/nbprodbyperesince2026/")
-  peres_spie_brut <- http_get(url = paste0(url_peres_spie, num_cheptel))
+  peres_spie_brut <- http_get(url = paste0(url_peres_spie, cheptel))
   peres_spie <- as.data.frame(peres_spie_brut, stringsAsFactors = FALSE)
   colnames(peres_spie) <- c('ANIM','NBPRODSPIE')
   peres_spie$NBPRODSPIE <- as.numeric(peres_spie$NBPRODSPIE)

R/project/ecow_calculations.R

@@ -49,7 +49,7 @@ calcul_ecow_by_chep <- function(cheptel, step = 3) {
       by = c("pereGenetique" = "anim")
     )
   # Récupère les produits ajout des données manquantes
-  produits_cheptel <- add_data_ecow(cheptel_ecow$produits, cheptel_ecow$nomsparents, czhbc)
+  produits_cheptel <- add_data_ecow(cheptel_ecow$produits, cheptel, cheptel_ecow$nomsparents, czhbc)
   
   
   ###################################################################################################################
@@ -71,9 +71,6 @@ calcul_ecow_by_chep <- function(cheptel, step = 3) {
 
   prod_vaches_corr <- apply_effet_chep(produits_vaches, effets$effets_chep, effets$rapport_MF)
   
-  # On récupère les coefficients de pondération pour les pointages au sevrage 
-  pps <- params_ponderation$pointage$sevrage
-  
   # Ajout à la table vache des informations synthétisées de leur veaux
   synth_brute_vaches <- get_synth_prod_parent(vaches, prod_vaches_corr, params_ponderation)
   
@@ -133,7 +130,7 @@ calcul_ecow_by_chep <- function(cheptel, step = 3) {
     filter(sexe == 2)
   
   # Petits produits issus des filles des taureaux nés dans le cheptel
-  pprod_filles_taureaux <- add_data_ecow(cheptel_ecow$petits_produits, cheptel_ecow$nomsparents, czhbc)
+  pprod_filles_taureaux <- add_data_ecow(cheptel_ecow$petits_produits, cheptel, cheptel_ecow$nomsparents, czhbc)
   
   # Calcul de la synthèse par fille de leur produits
   synth_filles_taureaux <- get_synth_prod_parent(filles_taureaux, pprod_filles_taureaux, params_ponderation)
@@ -189,7 +186,7 @@ calcul_ecow_by_chep <- function(cheptel, step = 3) {
   ###################################################################################################################
   message("Début partie Lignées")
   fondatrices <- cheptel_ecow$fondatrices
-  descendants <- add_data_ecow(cheptel_ecow$descendants, cheptel_ecow$nomsparents, czhbc)
+  descendants <- add_data_ecow(cheptel_ecow$descendants, cheptel, cheptel_ecow$nomsparents, czhbc)
 
   vaches_lignees <- descendants %>% filter(anim %in% descendants$mereGenetique)
   produits_lignees <- descendants %>% filter(mereGenetique %in% vaches_lignees$anim)

R/project/preprocessing.R

@@ -9,11 +9,11 @@ source(here::here('R/common/utils.R'))
 #' Met en forme le tableau des produits des vaches
 #' Ajoutes les colonnes nécessaires au calcul du rang ecow des vaches
 #' @param produits_vaches dataframe. Tab des produits des vaches du cheptel
-add_data_ecow <- function(liste_produits, noms_parents, czhbc){
+add_data_ecow <- function(liste_produits, cheptel, noms_parents, czhbc){
 
   #Ajout d'une colonne avec le nombre de produits IPG (croisement base SIG et SPIE)
-  parents_ipg <- get_parents_ipg()
-  liste_produits <- base::merge(liste_produits, get_parents_ipg(), by.x='anim', by.y='ANIM', all.x=T, all.y=F)
+  parents_ipg <- get_parents_ipg(cheptel)
+  liste_produits <- base::merge(liste_produits, parents_ipg, by.x='anim', by.y='ANIM', all.x=T, all.y=F)
   noms_parents <- as.data.frame(noms_parents)
   liste_produits$nommere <- noms_parents$V2[match(liste_produits$numeroMipg, noms_parents$V1)]
   liste_produits$nompere <- noms_parents$V2[match(liste_produits$pereGenetique, noms_parents$V1)]
@@ -319,6 +319,9 @@ get_note_carriere <- function(v_ref, params_ponderation){
 
 get_note_campagne <- function(prod_vaches_corr, params_ponderation){
   
+  # On récupère les coefficients de pondération pour les pointages au sevrage 
+  pps <- params_ponderation$pointage$sevrage
+
   # Groupement et synthèse des données des produits par vache / date de naissance / rang de vélage de la mère
   # Ca permet de grouper les jumeaux
   synth_prod_vache <- prod_vaches_corr %>%